光绪十三年（1887） 丁亥39岁
黄氏入吴大潋幕府，其戊子年题记《寄庵集古印》日：“伯惠嗜古犹贪，夫嗜财不弃，断简残篇犹贪，夫不弃鹅眼综圈也，与陵有同嗜焉。岁丁亥，陵来东粤，就食吴意翁门下，因得尽睹意翁所藏，鼎彝而外古印尤夥，从前潘氏听飘楼蓄古铜印六百钮，粤中淡铜印者必举潘以抗之，今意翁藏几溢潘四倍，大观哉。陵得一月暇，尽蜕入吾箧中，至愿也。今思之，犹生怀喜心。锺总百六十余印赠伯惠，伯惠分粘四册，非复从前，若废纸者，果与陵有同嗜焉，所赠不谬，故记之。戊子十月，黄土陵。”（黄氏京师约先回黟县，后再赴广州，期间数月而已。）
黄氏受吴大潋之邀协助院长梁鼎芬，主持广雅书局与广雅书局校书堂日常工作，书局所刻几百种书籍之扉页篆书多出其手，得意之笔尚于背面写“光绪某年黄士陵署”字样。广雅书院特制“广雅书院”青砖及印有“广雅“的瓦当，乃至藏书橱两门用磨沙玻璃制“广雅”二字均是黄氏手笔。且文革前仍存之《广雅书院教规》，《创建广雅书院奏折》，《请颁御书扁额折》的篆额虽无题款，而黄氏手书无疑。再如张之洞篆《许君说文解字序》亦风格与黄氏相似，可能即是黄氏手笔。
期间，黄氏个人印风己逐渐形成，尤其汉金碑版文字入印令人有耳目一新之感。另外金石书画创作亦丰，鬻艺虽有收入，然生活仅饱暖而已，见致双忽雷阁主人刘世珩札日：“陵书局行校，自惭空疏，砚田收入，仅供饱暖。所幸未为同人见恶，惟此可为知己日。”
是年黄氏辑自刻印成《黄牧甫印谱》二册。
五月，吴大潋借到川沙沈树镛所藏宋拓《刘熊碑》，以赵之谦双勾本校定，邀黄氏用端石重为摹勒。
七月，黄氏与尹伯圜合作为吴大潋编《十六金符斋印存》三十册。
十二月，刻白文印“梅溪读书”，款日：“梅溪舍人嗜陵篆，属镌石甚多，苛可存者皆存之不磨去，前日枉顾衰以见示，即累累若若者，皆陵篆也，目今观之，颜为之汗矣，竭力作此用副知己之爱。光绪丁亥十二月，黄士陵。”
十二月，刻朱文印“孙季子”，款日：“虢季子盘字，仿为竺生四哥。士陵时丁亥十二月。”
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